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2021,小金与您有个约定

作者:武汉金开瑞生物工程有限公司 2021-02-04T17:00 (访问量:5979)


一、酵母单杂交

酵母单杂交技术是在酵母双杂基础上发展而来的一种研究核酸-蛋白相互作用的工具,被广泛用于研究真核细胞内基因的表达调控,如鉴别DNA结合位点发现潜在的结合蛋白基因、分析DNA结合结构域信息等。


二、核蛋白酵母双杂交

核蛋白酵母双杂交技术最初由Fields等人在研究酵母转录因子GAL4性质时建立,后续经过不断改进已发展成为一种成熟的蛋白-蛋白互作研究工具,具有简便、灵敏、可反映蛋白在活细胞内互作真实情况的特点,被广泛应用于互作蛋白的筛选、蛋白相互作用的鉴定/验证、蛋白互作机理的探究、蛋白连锁图谱绘制等工作。


三、核酵母单/双杂交点对点验证流程简介及图片分析

A为诱饵,B为猎物。

筛选涉及到的报告基因:

1HIS3

2ADE2

3MEL1

诱饵质粒PGBKT7携带trp基因, 猎物质粒PGADT7携带Leu基因。

筛选涉及到的平板:DDO[SD/-Leu/-Trp]DDO/X[SD/-Leu/-Trp/X-α-gal]TDO /X [SD/-Leu/-Trp/HIS3/X-α-gal]QDO /X[SD/-Leu/-Trp/HIS3/Ade2/X-α-gal]

1、诱饵自激活验证

分析:诱饵质粒重组质粒PGBKT7-A和猎物空载PGADT7共转化Y2Hgold酵母菌株。(1)涂布DDO平板能够生长,说明诱饵PGBKT7-A+ PGADT7已成功转入宿主菌中且对宿主菌无毒性;(2)涂布TDO平板,不能生长,说明诱饵PGBKT7-A+ PGADT7无自激活现象,不能激活宿主菌报告基因his的表达;(3)涂布QDO平板没长,说明诱饵PGBKT7-A+ PGADT7无自激活现象,没有激活报告基因ADE2

2、共转验证——阴阳性对照

3、共转验证——实验组

分析:诱饵重组质粒PGBKT7-A和猎物重组PGADT7-B共转化Y2Hgold酵母菌株。(1)涂布DDO平板能够生长,说明诱饵PGBKT7-A+ PGADT7-B已成功转入宿主菌中且对宿主菌无毒性;(2)涂布TDO平板能生长,说明诱饵PGBKT7-A+ PGADT7-B能够互作,激活了宿主菌报告基因HIS3的表达;(3)涂布QDO平板能长,说明诱饵PGBKT7-A+ PGADT7-B能够互作,同时激活了报告基因HIS3ADE2的表达。


4、双杂点种图

1自激活: Y2H[PGBKT7-A+ PGADT7]

2实验组: Y2H[PGBKT7-A+ PGADT7-B]

3阳性对照: Y2H[pGBKT7-53+pGADT7-T]
4
阴性对照: Y2H[pGBKT7-lam+pGADT7-T]

5、酵母单杂点对点验证示意图

P为诱饵启动子,B为猎物。

单杂筛选报告和抗性基因:

AbAr/ AUR-CAUR1基因的一个显性突变版本,编码肌醇磷酸化神经酰胺syn- thase酶。AUR1-CY2HGold/ Y1HGold酵母株中表达,是由于蛋白质与蛋白质的相互作用,使GAL4转录激活和DNA结合域接近。可以添加ABA进行背景抑制。,

诱饵质粒PABAI携带Ura基因,猎物质粒PGADT7携带Leu基因。

筛选所用到的平板:SD/- LeuSD/- Leu/+AbA


自激活结果分析:PGADT7空载转化含诱饵启动子PAbAi-PY1Hgold酵母菌株。

1)涂布SD/-Leu平板能够生长,说明诱饵PAbAi-P已成功转入宿主菌中且对宿主菌无毒性;

2)涂布SD/-Leu/AbA(100ng/ml) SD/-Leu/AbA(200ng/ml) 平板能生长,说明200ng/mlAbA不能抑制报告基因AbAr/ AUR-C

3)涂布SD/-Leu/AbA(500ng/ml) SD/-Leu/AbA(800ng/ml)SD/-Leu/AbA(1000ng/ml)平板没长,说明能够抑制报告基因AUR1-C的最低AbA浓度为500ng/ml,后续可用AbA(500ng/ml)进行共转验证。如果AbA最高抑制浓度1000ng/ml仍然能够生长,则只能考虑截短诱饵启动子。

6、共转验证——阴阳性对照


7、共转验证——实验组


分析:诱饵启动子重组质粒PAbAi-P转化Y1Hgold酵母菌株涂布SD/-Ura平板,挑取单克隆菌制备成感受态,将猎物重组质粒PGADT7-B转化到Y1Hgold PAbAi-P 】中。(1)涂布SD/- Leu平板能够生长,说明猎物重组质粒PGADT7-B已成功转入宿主菌中且对宿主菌无毒性;(2)涂布SD/- Leu /+AbA (500ng/ml)平板能生长,说明诱饵PAbAi-P + PGADT7-B能够互作,激活了宿主菌报告基因AbAr/ AUR-C的表达。

8、单杂稀释点种图

四、酵母单/双杂点对点技术优势:

1. 转化效率高,较少假阴性;

2. 设置严格的对照实验,排除假阳性和假阴性;

3. 酵母双杂系统采用多个报告基因,且每个报告基因上游调控区各不相同,可大幅度减少假阳性;

4. 报告基因整合到染色体上,使基因表达水平稳定,消除了由于质粒拷贝数变化引起基因表达水平波动而造成的假阳性;

5. 严格设置点种验证实验菌体生长状态,进一步验证是否互作及互作强弱;

6. 严格保存原始实验数据便于溯源。


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