浙大: 测序鉴定小白菜花粉发育阶段miRNAome-技术前沿-资讯-生物在线

浙大: 测序鉴定小白菜花粉发育阶段miRNAome

作者:联川生物技术公司 2014-04-21T14:21 (访问量:3133)

花粉发育是开花植物生命周期的一个重要过程,也是影响农作物种子的产量和质量的主要因素。microRNAs(miRNAs)是有调节功能的内源性非编码小分子RNA,是植物生长过程中发育和应激反应过程中必不可少的。然而,目前对miRNA在开花植物有性生殖上的功能了解有限。为此,浙江大学曹家树教授领衔团队对参与花粉发育过程的miRNA做了深入探索*,成果发表在近期的BMC Genomics上。


研究人员首先构建两个独立小RNA文库,分别来自小白菜Brassica campestris ssp. chinensis雄性不育系Bcajh97-01A和雄性可育系Bcajh97-01B的花蕾,然后进行高通量测序分析。鉴定出了8个来自已知miRNA前体另一条臂上的新miRNA54个新的保守miRNA以及8个新的miRNA。发现了25对新的miRNA/miRNA*。研究人员还发现在所有已确定的miRNA18个差异表达的miRNABcajh97-01ABcajh97-01B的花蕾之间有超过两倍的改变。qRT-PCR分析表明,大多数差异表达的miRNABcajh97-01B的花蕾中优先表达。降解组测序分析表明,一共有7miRNA15个靶基因被鉴定出来(上述测序工作均由联川生物承担完成)。


上述发现综述了与花粉相关的潜在miRNA以及miRNA与它们靶基因的相互作用,这为探索miRNA在花粉发育过程中发挥的作用提供了重要的线索。



* Jiang J, Lv M, Liang Y, Ma Z, Cao J. Identification of novel and conserved miRNAs involved in pollen development in Brassica campestris ssp. chinensis by high-throughput sequencing and degradome analysis. (2014) BMC Genomics 15:146 [article]



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