利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序
ATAC-seq可以检测染色质开放区域，其原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质区域的特性，对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序和富集分析。
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DNA甲基化检测--重亚硫酸盐的测序法（Bisulfite Genomic Sequence，BSP）
重亚硫酸盐的测序法是一种灵敏的能直接检测分析基因组DNA甲基化模式的方法。重亚硫酸盐处理后，用针对改变后的DNA序列设计特异性引物并进行聚合酶链式反应（PCR）。
全转录组测序
真核生物转录组测序的研究对象为特定组织或细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括 mRNA、LncRNA和环状RNA 。